故事讲述了被分到问题学生云集的D班的绫小路清隆和他的同学们在学校里挣扎求生的故事。在TV动画第四季《欢迎来到实力至上主义教室 第四季：二年级第一学期》中，春假过后，绫小路和轻井泽成为了情侣，而堀北也不再崇拜她才华横溢的哥哥岳。随着他们关系的逐渐变化，他们也升入了二年级。绫小路和其他二年级新生即将迎来他们的第一场特殊考试——笔试，他们将与一年级新生搭档。然而，一年级新生中竟潜伏着月城从白屋派来的刺客。这种跨越年级界限的全新关系，究竟会带来风暴还是平静？校园生活的第二年就此拉开帷幕。南宫逝风努力地往上皱着眉头，往上挑着眉毛，让自己的眼睛睁大，控制即将流出眼眶的泪：“我也是一个很俗的男人，虽然我比其他的男人都丑，可是男人的心性，我都有。我想过看到她过得不好，看到她的后悔，希望我回去时她抱住我的腿说后悔了，然后我再狠狠一脚踢开她潇洒而去。也想过看到她过得好我会嫉妒的发狂，说不定将他俩都杀了……，但我终究只是想一想，不敢去。”